MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016827	AAAG	2	8	56	63	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016827	ATAC	2	8	761	768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016827	TAAA	2	8	800	807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016827	AG	3	6	811	816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016827	T	7	7	1509	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016827	TAAT	2	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016827	TCC	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016827	TAAT	2	8	2112	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016827	AAT	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016827	ATA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016827	T	6	6	2170	2175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016827	GAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016827	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016827	TAA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016827	AGG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016827	TGA	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016827	AAGA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016827	AT	3	6	5234	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016827	TA	3	6	5251	5256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016827	CTT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016827	GGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016827	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016827	G	9	9	5662	5670	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016827	AGC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016827	TAG	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016827	TAA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016827	GTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016827	ATA	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016827	ACA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016827	TCA	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016827	AT	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016827	CTC	2	6	8567	8572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016827	GAG	2	6	8663	8668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016827	TTG	2	6	8672	8677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016827	TAT	2	6	8689	8694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016827	T	6	6	8715	8720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016827	TGG	2	6	8726	8731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016827	TCC	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016827	T	6	6	8827	8832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016827	AAC	2	6	8915	8920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016827	TGT	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016827	AATA	2	8	9001	9008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016827	GATAA	2	10	9028	9037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016827	CTAA	2	8	9039	9046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016827	TCA	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016827	ATT	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016827	ATCA	2	8	9167	9174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016827	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016827	TTA	2	6	9262	9267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016827	ATCA	2	8	9272	9279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016827	T	7	7	9287	9293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016827	CTC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016827	ATG	2	6	9388	9393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016827	TTAAGT	2	12	9399	9410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016827	AAC	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016827	AT	3	6	9452	9457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016827	AGTT	2	8	9505	9512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016827	T	6	6	9561	9566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016827	T	6	6	9666	9671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016827	ATT	2	6	9692	9697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016827	T	6	6	9696	9701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016827	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016827	ATA	2	6	9752	9757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016827	T	8	8	9782	9789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016827	CTG	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016827	ACT	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016827	T	6	6	9991	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016827	AATTA	2	10	10126	10135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016827	ATT	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016827	ATC	2	6	10225	10230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016827	ATA	2	6	10280	10285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016827	TG	3	6	10317	10322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016827	ATT	2	6	10374	10379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016827	TA	3	6	10395	10400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016827	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016827	TGA	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016827	ATTTAC	2	12	10881	10892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016827	ATATA	2	10	10909	10918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016827	AATT	2	8	10928	10935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016827	TTA	2	6	11583	11588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016827	AAG	2	6	11606	11611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016827	TAT	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016827	TGC	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016827	AAG	2	6	11711	11716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016827	AAT	2	6	11729	11734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016827	TAG	2	6	11862	11867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016827	ATA	2	6	11927	11932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016827	TTA	2	6	11970	11975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016827	CAT	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016827	GAAA	2	8	12053	12060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016827	AAC	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016827	TTG	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016827	T	7	7	12108	12114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016827	AAT	2	6	12158	12163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016827	AATA	2	8	12198	12205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016827	ATTAA	2	10	12261	12270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016827	AT	3	6	12720	12725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016827	T	6	6	12733	12738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016827	TATTT	2	10	12746	12755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016827	AT	3	6	12794	12799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016827	T	6	6	12838	12843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016827	A	6	6	12905	12910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016827	AAT	2	6	12925	12930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016827	ACT	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016827	ATA	2	6	13052	13057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016827	ACA	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016827	TGT	2	6	13095	13100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016827	TAT	2	6	13718	13723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016827	T	7	7	13769	13775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016827	ATA	2	6	13794	13799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016827	A	6	6	13842	13847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016827	TAAT	3	12	13882	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016827	CT	3	6	16095	16100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016827	ATA	2	6	16166	16171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016827	TAG	2	6	16235	16240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016827	TGT	2	6	16254	16259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016827	T	7	7	16335	16341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016827	T	6	6	17514	17519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016827	TGT	2	6	17521	17526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016827	CAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016827	AT	3	6	17607	17612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016827	TATG	2	8	17636	17643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016827	TAA	2	6	17650	17655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016827	TAT	2	6	17660	17665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016827	AT	3	6	17688	17693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016827	TA	3	6	17723	17728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016827	ATT	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016827	TA	3	6	17739	17744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016827	AAATT	2	10	17774	17783	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016827	T	6	6	17830	17835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016827	CCA	2	6	17849	17854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016827	TACA	2	8	17876	17883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016827	T	6	6	17886	17891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016827	TTATA	2	10	17908	17917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016827	TGT	2	6	17932	17937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016827	T	6	6	18017	18022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016827	A	6	6	18061	18066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016827	ACT	2	6	18091	18096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016827	ACAA	2	8	18120	18127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016827	GTA	2	6	18142	18147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016827	T	7	7	18267	18273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016827	GACG	2	8	18340	18347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016827	GTTT	2	8	18367	18374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016827	T	7	7	18383	18389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016827	TCAA	2	8	18441	18448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016827	CTTG	2	8	18459	18466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016827	CAA	2	6	18470	18475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016827	GATTTA	2	12	18497	18508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016827	A	7	7	18517	18523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016827	ATA	3	9	18533	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016827	TGT	2	6	18560	18565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016827	GGT	3	9	18566	18574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016827	CG	3	6	18582	18587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016827	TGG	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016827	CATTGA	2	12	19659	19670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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159	NC_016827	A	8	8	19711	19718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_016827	A	8	8	19791	19798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016827	AAT	2	6	19913	19918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016827	T	6	6	19924	19929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_016827	GTT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016827	TAAGT	2	10	20228	20237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016827	T	6	6	20240	20245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016827	T	8	8	20249	20256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_016827	TA	3	6	23067	23072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_016827	AAGCA	2	10	23106	23115	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_016827	G	6	6	23305	23310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016827	TAA	2	6	23400	23405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.